الهيكل التنظيمي لمشروع متجر الكتروني يتكون من الأنشطة والمهام التي يتم توزيعها بين العاملين والقيام بعمليات التنسيق والإشراف وهو بالضرورة مُوجه نحو تحقيق أهداف المؤسسة والتنظيم كما يُمكن اعتبارها أيضاً بكونها منظار للأفراد اتجاه مؤسستهم والبيئة المحيطة.
المدير العام يدير جميع رؤساء الأقسام من :
وبدورهم الاشراف على باقي الموظفين.